很多豬衣原體感染均為隱性感染，但是呼吸道和全身感染可導致食慾不振，體温高達39~41℃,可能出現呼吸困難、肺炎或關節炎，並持續4~8d。
懷孕母豬感染後引起早產、死胎、流產、胎衣不下、不孕症及產下弱仔或木乃伊胎。初產母豬發病率高，一般可達40%～90%，早產多發生在臨產前幾周(妊娠100～104天)發生，妊娠中期（50～80天）的母豬也可發生流產。母豬流產前一般無任何表現，體温正常，也有的表現出體温升高（39.5～41.5℃）。
懷孕母豬感染後引起早產、死胎、流產、胎衣不下、不孕症及產下弱仔或木乃伊胎。初產母豬發病率高，一般可達40%～90%，早產多發生在臨產前幾周(妊娠100～104天)發生，妊娠中期（50～80天）的母豬也可發生流產。母豬流產前一般無任何表現，體温正常，也有的表現出體温升高（39.5～41.5℃）。產出仔豬部分或全部死亡，活仔多體弱、初生重小、拱奶無力，多數在出生後數小時至1～2日死亡，死亡率有時高達70%。公豬生殖系統感染，可出現睾丸炎、附睾炎、尿道炎等生殖道疾病，有時伴有慢性肺炎。
1.後備母豬出現鼻涕樣排出物，無臭味。2.母豬返情率偏高，胎盤上會出現白斑或綠豆大小出血斑。3.母豬在分娩後3-5天會出現惡露增加的現象，在惡露中夾雜有較多的鼻涕樣分泌物。
流產型懷孕母豬感染後引起早產、死胎、流產、胎衣不下、不孕症及產下弱仔或木乃伊胎。初產母豬發病率高，一般可達40%～90%，早產多發生在臨產前幾周(妊娠100～104天)發生，妊娠中期（50～80天）的母豬也可發生流產。
豬衣原體感染的症狀:大多數為隱性感染。少數豬感染後，經過3~11天的潛伏期，可出現食慾不振，體温升高。仔豬有肺炎症狀，有些豬有多發性關節炎，腸炎（腹瀉），結膜炎等症狀。懷孕母豬可發生流產、死胎及弱胎。公豬可出現睾丸炎、附睾炎或尿道炎。
病豬發病突然，體温一般升高至40.5℃-41.0℃，最高達42℃，呈稽留熱，食慾下降，甚至廢絕；部分病豬咳嗽，呼吸困難，呈腹式呼吸；鼻腔流鼻涕，病程稍長的流膿性分泌物；眼結膜潮紅，流淚，嚴重者眼瞼水腫，眼角分泌物多；糞便乾燥，偶帶腸粘液；尿黃赤，偶有帶血。剛產下仔豬體弱，拉黃痢，脱水，吮乳無力，死亡率高；懷孕母豬除皮膚潮紅、體温升高、呼吸快、鼻腔分泌物增加外，主要表現後期流產嚴重，產死胎、產弱仔；有的仔豬出現神經症狀，盲目衝撞、轉圈。
主要有流產型、關節炎型、支氣管肺炎型和腸炎型，表現為妊娠母豬流產、死產和產弱仔，新生仔豬肺炎、腸炎、胸膜炎、心包炎、關節炎，種公豬睾丸炎等。治療以隔離病豬，深埋感染豬以及抗生素對症治療。
臨診上可表現為妊娠母豬流產、死產和產弱仔，新生仔豬肺炎、腸炎、胸膜炎、心包炎、關節炎，種公豬睾丸炎等。常因菌株毒力，豬性別、年齡、生理狀況和環境的變化而出現不同的徵候羣。
該病的潛伏期長短不一，短則幾天，長則可達數週乃至數月。依據臨診表現，可分為流產型、肺炎型、關節炎型和腸炎型等。
