選用抗病品種，加強田間管理，科學水肥管理等。
科學選育優良品種，做好病蟲害防治。
病害初期利用促50.0%多菌靈可濕性粉劑500倍液或者70.0%甲基託布津可濕性粉劑500倍液對其進行噴施噴施的時間是從心葉末期開始到抽雄期為止7d1次。
1、農業防治。減少菌原：播種前清潔田園、深翻土地；發病初期，摘掉老葉、病葉，減少再侵染原。改進栽培模式：寬窄行種植，加強通風透光，降低濕度；覆膜種植，保水保肥，保證其營養，提高其抗病性；增施磷、鉀肥，提高植物抗病能力。2、化學防治。防蟲：蟲子對玉米的危害直接導致玉米抗性的降低，後期會加重病害，建議在噴施玉米化控劑時加入氯蟲苯甲酰胺類藥劑，在化控的同時實現防蟲。防病：在病害發病初期，一般在玉米大喇叭口期噴施丙環唑或苯醚甲環唑復配嘧菌酯成分的藥劑，同時也可加入氯蟲苯甲酰胺及全營養葉面肥，在防病過程中，同時實現降低玉米穗螟、杆螟及穗腐的發生，並實現增產。
玉米小斑病的化學減少菌原，化學防治。
玉米小斑病的化學防治方法：在發病初期，可畝用25%吡唑醚菌酯懸浮劑40毫升，兑水50千克噴霧防治。
可選用70%代森聯（品潤）水分散粒劑、50%多菌靈可濕性粉劑、75%百菌清可濕性粉劑、80%代森錳鋅可濕性粉劑等500倍液噴霧，隔7-10天噴藥1次，共防治2-3次。用18.7%丙環·嘧菌酯懸浮劑50-70毫升/畝或25%嘧菌酯（阿米西達）1500-2000倍液，可達預防、治療和剷除的效果。
建議噴施苯甲嘧菌酯防治玉米小斑病。
做好田間管理，增施磷鉀肥，做好中耕除草工作，水分適宜苗期一定要控水。
