科技興棉、提高單產、增加效益，是保持我國棉花生產持續穩定發展的重要舉措。當前影響棉花生產水平提高的主要原因，除氣候因素外，存在的技術問題如下：
種植密度不合理當前我國棉花種植密度呈兩個極端的方向發展。長江和黃河流域棉區，每年密度以200株/畝的速率下降，有的每畝種植1500株/畝以下；而西北密度越來越大，每年以300～400株/畝的速率增加，密度達到18000～20000株/畝，有的超過20000株/畝。試驗表明，棉花過稀過密，都不利於奪取高產。
棉花早衰面積越來越大由於早衰，棉花減產幅度達到兩成。其原因是：第一，近年來棉花黃萎病是制約單產提高的最主要病害，三大棉區呈現較大範圍流行的趨勢，以黃河流域最為嚴重，長江流域次之。據監測，2003～2004年發病面積達到4000萬畝，分別佔總面積的54%和46.4%。病情指數越來越高，棉株“落葉垮稈”2003年佔總面積的10%，2004年佔總面積的20%，導致減產15%～20%，嚴重田塊絕收，一些棉花基地大縣將會因病必須改種其它作物。第二，生理性病害———紅葉莖枯病，大多由營養失調引起。
棉花品種“多亂雜”棉農無所適從。全國播種品種（包括沒有審定的品系、組合、材料、代號和不知名等，後同）2001年120個，2002年152個，2003年210個，2004年266個，比2003年增56個，增幅26.7%。我國常年種植品種數120個，當前主要推廣品種不突出，2003～2004年全國沒有一個品種的播種面積達到10%。
為此，解決的方法主要有：進一步調整棉花生產佈局結構鞏固棉花生產優勢區域，穩定長江流域、黃河流域和西北內陸“三足鼎立”的新型結構。進一步建設國家優質棉花生產基地，重點建設高產穩產棉田，扶持雜交棉製種基地的建設。調整生產佈局，調減低產棉田和風險棉區面積，由於老棉區病害發生日益嚴重，減產減收、損失慘重。在適宜產區的一縣之內和一鄉鎮之內，應有計劃有目的由重病產地向輕病產地轉移，由病產地向非病產地轉移。
推廣抗病高產優質品種和精加工種子大力推廣雜交棉和抗蟲棉，提倡使用包衣種子。主要產區要明確主推品種，雜交棉產量高、品質好、抗逆性強，應大力推廣，力爭F1雜交種子在2004年種植面積17%的基礎上提高到20%。包衣種子品質好，還具有防病效果，提倡精量播種。
示範應用增產節本增效技術一是合理密植。長江雜交棉合理密度1500～2500株/畝，不應低於1500株/畝；黃淮平原3000～4000株/畝，華北平原北部4000～5000株/畝，西北12000～14000株/畝。二是增施有機肥，平衡施用化肥，適當減氮穩磷補充鉀肥，在缺硼缺鋅棉田施用硼鋅微肥。提倡化肥深施，肥料與水分合理運籌。三是推廣育苗移栽，地膜覆蓋，節水灌溉、化學調控和病蟲害防治技術。當前育苗移栽技術退化嚴重，提倡使用中大缽體，培肥牀土，適時播種，加強苗牀管理，育壯苗早苗。四是綜合治理棉花病害，示範“健株栽培技術”，選擇抗耐病品種，提倡增施有機肥和鉀肥，合理輪作，節（控）水灌溉，葉面噴施磷酸二氫鉀，推遲發病，促進病株快速恢復。要加強棉花病害綜合治理技術的研究。五是積極穩步示範棉花“兩無兩化栽培技術”。
