1、選用抗病品種不同地區應根據當地保護地西葫蘆發病特點，選擇種植適當的抗病品種。
2、避免與白菜類蔬菜連茬，前茬選擇最好是葱蒜類或茄果類蔬菜。
3、整地前必須用生石灰或高錳酸鉀進行土壤消毒，生石灰667平方米用量為50-100千克，高錳酸鉀用量為2-2.5千克。
4、嫁接育苗。採用黑籽南瓜作砧木進行嫁接栽培，促使植株根系強大，耐低温能力提高，抗病性增強。
5、採用高壟覆蓋地膜栽培。
6、合理施用氮肥，增施磷鉀肥。
7、注意灌水，有條件的採取膜下滴灌，避免大水漫灌，雨後及時排水，避免田間積水；
8、加強其它病蟲害的防治，整個生育期主要做好白粉蝨、蚜蟲危害的防治。
9、農事操作要仔細，避免機械損傷，可適當加大行距，縮小株距，這樣有利於田間操作。
10、發現病瓜及時摘除深埋，病瓜上面撒施生石灰消毒。
11、西葫蘆定植時、整枝打杈前用藥劑預防；在軟腐病發病初期開始，選用72%農用鏈黴素等噴灑，每隔7天交替噴霧一次，連續防治2—3次。
