春寒料峭、咋暖還寒，加上易遭受陰冷天氣，使春茬黃瓜在栽培過程中經常出現黃瓜幼苗莖基部或嫁接口處腐爛、流膠的現象，造成黃瓜缺苗斷壟。其發生主要受低温弱光高濕影響後，植株體內充水，遭受病菌侵染。其主要被害症狀是莖基部水漬狀，表皮完好，內部腐爛，維管束不變色，在莖裂口處有膠狀物流出。多發生於嫁接口以上黃瓜子葉下部。侵染病害主要有疫病、蔓枯病等，並伴隨細菌性病害混合發生。其防治措施如下：
防止低温危害：保證嫁接後及幼苗期最低氣温不低於13℃，晝夜温差在15℃左右；定植時地温不低於15℃。這樣基本可預防嫁接黃瓜莖基腐病的發生。
藥劑灌根：在苗期和定植緩苗後用惡黴靈等加生根劑灌根防病。
及時用藥控制病害：病害發生後要及時選用內吸性、真菌和細菌均能防治的農藥復配劑進行防治。有效配方有：農用鏈黴素或中生菌素加霜黴威或甲霜靈重點噴病莖部，3～4天一次，連噴2次可基本治癒；此外用100倍0.15%四黴素塗莖效果也很好。
