魚用復混肥在水温15℃以上使用效果較好，一般作追肥使用，在缺肥少肥地區，可作基肥使用，若與有機肥料配合使用，收效更佳，每畝水面年用量60-80千克。採用魚用復混肥養魚的池水中，浮游生物量一般在20-50毫克/升範圍，優勢種羣多見於綠藻、裸藻、硅藻、隱藻。使用方法一般有三種：
一、潑灑法
將肥料加水溶解後，全池均勻潑灑，用量每畝每次1-2千克，3天1次，或每畝每次4-5千克，10-15天1次;
二、噴灑法
主要用於大水體，將溶解後的魚用復混肥置入船倉中，然後採用機械噴灑，用量同潑灑法。
三、掛袋法
使用時將復混肥料裝入袋、簍或浮性多孔釋放器中，懸掛於水的上層，容量為2-3.5千克，每畝魚池放2只浮性多孔釋放器，經10-15天釋入後，容器內再換入新肥料繼續使用。也可潑灑法和掛袋法並用，在池水透明度較大的情況下，先用潑灑法，當透明度在22-30釐米時，再用掛袋法，能保持水色穩定、持久。
