腳腐病，又稱裙腐病，俗稱料蔸疤，主要為害根頸部和根羣，發病部位大多在土面上下10釐米左右的根頸。病部呈不規則的水漬狀，黃褐色至黑褐色，樹皮腐爛，具酒糟味，常流出褐色膠液。病部有時擴展到根部，引起主根、側根甚至鬚根大量腐爛。病樹開花結果多，但果小提前轉黃，味酸，易脱落。病菌以菌絲體在有病的柑桔樹基部越冬，也可以菌絲體或卵孢子隨着殘體遺留在土壤中越冬。寄主以甜橙、檸檬、㰀檬發病最重，桔次之；枳和酸橙作砧木較抗病。
防治方法
1、土地選擇整地時對低凹地帶，可挖80釐米深的排水溝進行排水，對土壤整地時就進行土壤改良，即挖除粘重土壤80-100釐米，用有機質肥土進行改良，定植時凡是低凹、粘重土實行挖溝提土，定植於高畦面上，防止深溝定植。
2、利用抗病砧木，是預防病發生最有效的措施，當前以枳砧抗力最強。
3、密植果園，堅持年年翻耕桔畦，增加陽光照射土壤。在發病季節經常檢查桔園發病情況，發現病斑，用刀刮除外表泥土及粗皮，再用刀縱刻病部深達木質部，刻條間隔約1釐米，然後塗藥，任選下列中一種：90%三乙膦酸鋁可溶性粉劑100倍液，25%瑞毒黴可濕性粉劑100-100倍液，64%殺毒礬可濕性粉劑400-600倍液等。同時，根部換土，即掏除根部帶病土壤，換上沙壤土，並實行靠接換砧（病株周圍栽上3-4株砧木，進行靠接換砧）。
