農業防治主要有清潔田園，及時清除病株，集中燒燬；採收結束後清除田間殘株落葉，集中處理，防止病害擴散，減少病菌基數。合理輪作。與非寄主植物實行3年以上輪作，如與葱蒜類、水稻等，可有效地減少土壤中的病原菌數量，也可顯著提高養分的利用率。
防治茄子枯萎病時要選用無病的種子，播種前先用温水浸種或者用硫酸銅1000倍液浸泡十分鐘。還要注意牀土消毒，消毒後在播種。此外，還要及時開好排水溝，儘量避免積水情況。及時施肥，保證養分充足也可有效預防。
清潔田園、合理輪作、嫁接換根、穴盤育苗、合理耕作、科學管理、平衡施肥。
實行3年以上輪作，施用充分腐熟的有機肥，採用配方施肥技術，適當增施鉀肥，提高植株抗病力。採用高畦種植，合理密植，注意通風透氣;施用石灰調節土壤酸鹼度，造成不利病菌存活環境;合理灌溉，嚴禁大水漫灌，雨後排水，促進根系生長。
