在種植感病寄主和土壤有足夠菌量時，播種後至幼苗4－5葉期土壤的温濕度成為病菌侵染多少的決定因素，因此春播、早播、土壤偏乾和冷涼山區發病重。品種抗性有明顯差異。長期連作感病品種，由於增加土壤菌量，可加重病害的流行。
玉米黑絲穗病是土壤和種子帶菌，病菌在土壤中可存活2-3年，春季種子萌發時感染病菌，土壤含水量在18-20%，温度在20-25℃時發病率高。
病菌在土壤、糞肥或種子上越冬，成為翌年初侵染源。種子帶菌是遠距離傳播的主要途徑。厚垣孢子在土壤中存活2～3年。幼苗期侵入是系統侵染病害。玉米播後發芽時，越冬的厚垣孢子也開始發芽，從玉米的白尖期至4葉期都可侵入，併到達生長點，隨玉米植株生長髮育，進入花芽和穗部，形成大量黑粉，成為絲黑穗，產生大量冬孢子越冬。玉米連作時間長及早播玉米發病較重；高寒冷涼地塊易發病。沙壤地發病輕。旱地墒情好的發病輕；墒情差的發病重。
