植物矮，乾燥，白穗黑腳，也稱為“三黑”，即黑根、黑腳、黑膏藥。
芽鞘受侵染變褐，繼而爛芽枯死，不能出苗。主要發生在小麥的葉鞘和莖稈上。小麥紋枯病菌可以侵染剛發芽的種子，幼苗出土前幼芽鞘變褐，繼而腐爛成爛芽不能出土。
小麥全蝕病由小麥頂囊殼菌引起，是一種典型的根部病害。潮濕情況下，在莖基部表面及葉鞘內佈滿緊密交織的黑褐色菌絲層，形成基腐性的黑腳。剝開病株基部葉鞘，可見到該病獨特的黑膏藥狀物質，上密佈黑褐色顆粒狀子囊殼。
主要為害小麥地下部分根部和莖基部1-2節處。小麥抽穗後田間病株成簇或點片狀發生早枯白穗，病根變黑，易於拔起。在莖基部表面及葉鞘內佈滿緊密交織的黑褐色菌絲層，呈“黑腳”狀，天線後顏色加深呈黑膏藥狀，上密佈黑褐色顆粒狀子囊殼。
