生前用飽和鹽水漂浮法或糞便塗片查到球蟲卵囊，或死後取腸粘膜觸片或刮取腸粘膜塗片查到裂殖體、裂殖子或配子體，均可確診為球蟲感染，但由於雞的帶蟲現象極為普遍，因此，是不是由球蟲引起的發病和死亡，應根據臨診症狀、流行病學資料、病理剖檢情況和病原檢查結果進行綜合判斷。
球蟲病多發生於温暖而多雨的季節,3個月齡以內的雞，特別是3周至1。5月齡的雞最易發病。每種艾美耳球蟲幾乎都有自己的侵害部位,除少數艾美耳球蟲外，大多數都寄生於腸絨毛的上皮細胞內，典型的損害，通常是腸道病原學診斷的一個具有價值的指標。
雞球蟲病對雛雞和育成雞的危害十分嚴重，15～50日齡的雛雞發生率高，死亡率可達80%以上。耐過的雛雞生長緩慢，發育不良。成雞多為帶蟲者，增重和產蛋受到一定影響。
