施用滴灌水溶肥時要注意以下幾點：
首先，水溶肥滴灌施肥時，先滴清水，等管道充滿水後開始施肥。施肥結束後立刻滴清水20-30分鐘，將管道中殘留的肥液全部排出（可用電導率儀監測是否徹底排出）。如不洗管，可能會在滴頭處生長青苔、藻類等低等植物或微生物，堵塞滴頭。
其次，大棚或温室長期用滴灌施肥會造成地表鹽分累積，影響根系生長。可採用膜下滴灌抑制鹽分向表層遷移。
再其次，注意水溶肥施肥的均勻性。滴灌施肥原則上施肥越慢越好。特別是對在土壤中移動性差的元素，延長施肥時間，可以極大地提高難移動養分的利用率。在旱季滴灌施肥，建議水溶肥施肥時間2-3小時。在土壤不缺水且保證均勻度的前提下，越快越好。
