條鏽菌夏孢子單胞，球形，表面有細刺，鮮黃色，孢子壁無色，具6～16個發芽孔。冬孢子雙胞，棍棒狀，頂部扁平或斜切，分隔處稍縊縮，褐色，上濃下淡，下部瘦削，柄短有色。
病原特徵：菌絲絲狀，有分隔，生長在寄主細胞間隙中，用吸器吸取小麥細胞內養料，在病部產生孢子堆。夏孢子單胞球形，鮮黃色，表面有細刺，大小（32～40）×22～29（um），有發芽孔6～12個。冬孢子雙胞，棍棒形，頂部扁平或斜切，分隔處略縊縮，大小36～68×12～20（um），柄短。
小麥條鏽病主要發生在葉片上，其次是葉鞘和莖稈及穗部。苗期染病，葉片上產生多層輪狀排列的鮮黃色夏孢子堆。成株葉片初發病時夏孢子堆為小長條狀，鮮黃色，橢圓形，與葉脈平行，且排列成行，像縫紉機軋過的針腳一樣，呈虛線狀，後期表皮破裂，出現鏽被色粉狀物，用手觸摸病斑，就在手上留下鏽粉。
真菌菌絲絲狀，有分隔，生長在寄主細胞間隙中，用吸器吸取小麥細胞內養料，在病部產生孢子堆。夏孢子單胞球形，鮮黃色，表面有細刺，大小（32～40）×22～29（um），有發芽孔6～12個。冬孢子雙胞，棍棒形，頂部扁平或斜切，分隔處略縊縮，大小36～68×12～20（um），柄短。
