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病原菌以菌絲體、孢子囊通過氣流、雨水、害蟲傳播。孢子囊萌發後,自寄主氣孔或直接穿透寄主表皮侵入。
西瓜霜黴病的病原菌越冬情況目前尚未明確。南方温暖地區病菌的孢子囊可隨季風向北吹送,成為第二年的初侵染源;北方寒冷地區病菌不能在露地越冬,棚室栽培的瓜類發病後產生孢子囊是第二年露地西瓜霜黴病的初侵染源。
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