斑馬魚的雌雄不難區分：雄斑馬魚魚體修長，鰭大，體色偏黃，臀鰭呈棕黃色，條紋顯著；雌魚魚體較肥大，體色較淡，偏藍，臀鰭呈淡黃色，懷卵期魚腹膨大明顯。
斑馬魚屬卵生魚類，4月齡進入性成熟期，一般用5月齡魚繁殖較好。
斑馬魚的繁殖比較容易。繁殖用水要求pH6.5-7.5,硬度6-8，水温25-26攝氏度。斑馬魚最喜歡自食其卵，因此繁殖缸內鋪小石頭及水草，便於落卵附着。繁殖時可按雌雄魚1：2的比例防入繁殖缸內，一般頭天晚上防入，第二天上午或中午就可以產卵受精。排完卵要將種魚撈出另養。一條雌魚每次可排卵300-1000粒不等。
受精卵經2-3天可孵出仔魚，再經2天仔魚開始遊動覓食，開始先以“洄水”喂之，10天后可改喂其他小型魚蟲。
斑馬魚的繁殖週期約7天左右，一年可連續繁殖6-7次，而且產卵量高。
