為使幼樹內部與外部的枝能獲得均衡的生長，達到較為理想自然圓頭形，應對樹冠上部生長過旺的大枝，多抹2～3次芽。但樹冠內的小枝，只要不是徒長枝和過密枝，應該全保留，據觀察這些長勢中庸的小枝，常是後來良好的結果母枝。
對樹冠上部生長過旺的大枝，多抹2～3次芽。但樹冠內的小枝，只要不是徒長枝和過密枝，應該全保留，據觀察這些長勢中庸的小枝，常是後來良好的結果母枝。對於生長強旺的檸檬幼樹，常常是夏梢抽發多，既不利於秋梢的抽發，也不利於花芽的分化，一般在立秋後，對夏稍適當短剪1／2至1／3，促使抽發更多的秋梢，使之下年多數也能開花結果。但長勢弱的檸檬幼樹，通常容易早開花，這對樹體生長不利，有的會形成未老先衰的“小老頭樹”。因此，應衣時疏除花蕾，使之形成良好的樹冠，而後開花結果。
