豬圓環病毒主要通過呼吸道和消化道傳播。病毒通過空氣中的飛沫和糞便等途徑，感染了豬的呼吸道和消化道黏膜，進入宿主細胞，開始複製和增殖。豬圓環病毒具有很高的變異性，不同的病毒株對宿主的感染力和致病性也存在差異，進一步增加了疫苗的研發和控制的難度。
豬圓環病毒感染後，主要靶標是豬體內的巨噬細胞和淋巴細胞。病毒通過與宿主細胞的受體結合，進入細胞內部，干擾宿主細胞的正常功能。豬圓環病毒的感染會抑制巨噬細胞的吞噬功能和抗原呈遞能力，導致豬的免疫系統受損。此外，豬圓環病毒感染還會導致炎症反應的增強，釋放出一系列的炎症介質，如細胞因子、炎性介質等，進一步損害宿主組織細胞。
豬圓環病的發病機理還涉及宿主的免疫反應和遺傳因素。病毒感染後，宿主會產生病毒特異性抗體，但由於病毒的高變異性，抗體的中和效應並不明顯。病毒還能逃避宿主的免疫監視和抗病毒免疫應答，導致感染過程長期持續。此外，宿主的遺傳差異也會影響病毒感染的嚴重程度和病理變化。
