兩者區別點：早疫病長黑色黴層，晚疫病長白色黴層；早疫病有明顯的同心輪紋，晚疫病無同心輪紋；早疫病呈海綿幹腐狀，晚疫病呈軟腐狀。
馬鈴薯早疫病主要發生在葉片上，發病初期葉片出現褐黑色水浸狀小斑點，後期擴大呈同心輪紋並乾枯。馬鈴薯晚疫病在葉片、莖蔓、薯塊都有發生，發病初期葉片出現水漬狀綠褐色小斑點，濕度大時病斑迅速擴展成黃褐至暗褐色大斑，薯塊在田間會發生腐爛，病斑處切開可見到皮下有一層薯肉變成紅褐色。
2種病害的病菌不同，雖然2種病害都是真菌引起的，但馬鈴薯晚疫病是由鞭毛菌亞門中的稱為致病的真菌引起；而馬鈴薯早疫病是由半知菌亞門中的稱為茄鏈格孢的真菌引起。
早疫病病斑黑褐色，圓形或近圓形，具同心輪紋，濕度大時病斑上產生黑色黴層，發病嚴重時，葉片乾枯脱落；晚疫病病葉先從葉尖葉緣生水浸狀綠褐色斑點，病斑周圍具淺綠色暈圈，濕度大時迅速擴展，呈褐色，產生一層薄薄白黴，乾燥病斑變褐乾枯易裂，區別於早疫病。
