土壤缺鎂是甜瓜缺鎂的主要原因。土壤缺鎂一是與土壤質地有關。二是與土壤的酸鹼性有關。温度過低也會引起缺鎂，當地温低於15℃以下時，甜瓜的根系成長受阻，此刻雖然土壤中不缺鎂，但由於甜瓜的根系成長發育欠好，也會按捺根系對鎂的吸收。此外，當甜瓜過量施用鉀肥和銨態氮肥時，會按捺甜瓜對鎂離子的吸收，然後誘發植株缺鎂。
防治方法有以下三種：
1.補施鎂肥
對土壤供鎂不足的田塊，可在甜瓜麥苗移栽定植前，隨基肥每畝補施硫酸鎂2-4公斤，或在基肥中增施鈣鎂磷肥。磷肥與鎂肥合作施用有助於對鎂的吸收。
2.操控氮、鉀肥用量
對鎂元素含量較低的土壤，要避免過量施入氮肥和鉀肥。在甜瓜成長期間，對氮、鉀肥最好採用少量多次的施用辦法。
3.進步温室温度
通過晚揭簾和早放簾等辦法進步温室温度，特別是在甜瓜坐瓜及膨大期後，一定要堅持地温在15℃以上。以進步對鎂元素的吸收能力。
4.葉面噴肥
對當下現已呈現甜瓜缺鎂症狀的温室，可葉面噴施0.5-1%的硫酸鎂水溶液，每5-7天1次，接連3-4次即可。
