1、板藍根白鏽病
這是由真菌中的一種藻狀菌引起的板藍根葉、莖、花部的病害。葉部發病初期，出現黃綠色小斑點，葉背面長出一隆起的、外表有光澤的白色濃泡狀斑點，破裂後散出白色粉末狀物，葉長成畸形，後期枯死。通常氮肥過多，植株柔嫩，雨水多，濕度大及時冷時暖時發病嚴重。
防治方法：
①及時間苗，清溝排水，中耕除草，降低田間濕度，促進植株生長健壯，增強抗病力。
②結合間曲剔除病苗，後期注意摘除病葉，減少病菌傳播。
③在發病初期噴1：1：120的波爾多液。
2、板藍根霜黴病
它是真菌中的一種鞭毛菌引起的葉部病害。在發病初期，葉片產生黃白色黃斑，葉背出現濃霜似黴斑，隨着病情發展，葉色變黃，最後呈褐色幹祜，植株死亡。一般在6月開始發病，7月份高温高濕發病嚴重。
防治方法：
①清潔田園，清除地內殘枝病葉，集中燒燬，減少病源。
②選擇排水良好的種植地，雨季及時排水。實行輪作。
③在發病初期用50%甲基託布津800~1000倍稀釋液，或50%多菌靈1000倍稀釋液噴灑。
3、板藍根白粉病
它是真菌中的一種藻狀菌引起的葉部病害。發病初期板藍根葉片出現灰白色的小點，病情加重後，病斑擴大，兩面呈灰白色斑塊，嚴重時整片葉呈灰白色，最後變為黃褐色，乾枯而脱落。
一般低温多濕，施氮肥過多，植株過密，通風不良易發病。
防治方法：
①排除田間積水，抑制病害的發生。
②合理密植，增施磷、鉀肥，使植株生長健壯，增強抗病力。
③在發病初期及時摘除病葉，用65%福美鋅可濕性粉劑300~500倍稀釋液噴灑。
4、板藍根菌核病
為害全株，從土壤中傳染。基部葉片首先發病，然後向上為害莖、莖生葉、果實。發病初期呈水潰狀，後為青褐色，最後腐爛。在高温多雨的5~6月間發病最重。
防治方法：
①水旱輪作或與禾本科作物輪作。
②增施磷鉀肥。
③及時排水，降低田間温度。
④於植株基部使用石硫合劑。
⑤在發病初期用65%代森鋅500~600倍液噴霧，隔7天噴1次，連續2~3次。
5、板藍根根腐病
被害板藍根植株地下部側根或細根首先發病，再蔓延至主根。根部發病後，地上部分枝葉發生萎蔫，逐漸由外向內枯死。發病適温29℃~32℃。
防治方法：
①、實行輪作。
②增施磷鉀肥。
③發病期噴灑50%託布津800~1000倍液。
④採用75%百菌清可濕性粉劑600倍液或70%敵可鬆1000倍液進行噴藥防治效果最佳。
