蘋果黑星病初次侵染為落葉上子囊果內的子囊孢子。再次侵染是由風、雨傳播的分生孢子。通常低温多濕有利於病菌的初次侵染和傳播，夏季也有利於病害發展；高温、乾燥時病害不利於傳播。
蘋果黑星菌的子囊殼大多在秋冬形成。在培養基上，20C和pH4.5~5.8時生長最適。實體形成後，在紫褐色的予實體層上產牛白霜狀擔孢子，擔孢子陸續成熟，隨風雨傳播，通過傷口侵入，在木質部定植，然後沿導管上下蔓延。春、秋雨季是病菌侵入的有利時期。樹體從感病到出現症狀需1~2年時間。發病後，重病樹1~2年死亡;輕病樹可活十多年，部分病樹還可自行恢復健康。該病的發生與果園地勢、管理水平及品種密切相關。土壤粘重、排水不良、鹽鹼過重、樹勢衰弱的果園發病重;果園管理粗放。傷口不及時保護等均易導致病害發生。大樹較幼樹易感病。蘋果各品種間感病性存在差異。
蘋果黑星病菌以子囊殼在落葉上越冬，以子囊孢子為主要的初侵染源。早春冷涼多雨，有利於孢子的擴散和病原菌侵染。春季，子囊孢子開始成熟，並藉助雨水和氣流釋放和傳播。
黑星病病菌主要在枝條潰瘍斑或芽鱗內越冬，在翌年遇雨後產生孢子開始釋放，夏季多雨時釋放最多，借風雨傳至果樹葉面，侵入組織，在花蕾開放與花瓣脱落期最易受侵染，病菌可不斷侵染，早春多雨氣温低發病早，病重。在夏季陰雨連續，地勢低窪，通風不良，濕度大的果園最容易發病。
蘋果黑星病菌以菌絲體在枝潰瘍和芽鱗內或子囊殼在落葉上越冬。子囊孢子到第二年春季成熟，田間分生孢子在6～7月份最多。病菌也可被蚜蟲傳播。寄主最易受害時期為花蕾開放與花瓣脱落期間，萼片上的病斑為以後侵染果實的最好菌源。因此，早春為病害發生的重要時期。
蘋果黑星病的傳播途經有種苗運輸傳播及風雨傳播。故首先做好檢疫工作。
