一、實行輪作，控制土壤傳播
實行輪作，防病效果較好。一般應把菜田分成3－5區，實行分區輪作。若實行育苗移栽，育苗地應選用多年未種過瓜的田地，袋裝育苗使用無瓜類病害的肥土。還應清理瓜田，集中燒燬病株殘體，噴施護樹大將軍進行地面消毒。
二、改進施肥技術，重視有機肥
生物肥料與常規肥料的混合漚(浸)後使用，不但可提高肥效，而且通過有益微生物的大量增殖，提高土壤有效養分，使根際有益微生物的比例大大提高，從而增強對病菌的拮抗能力，抑制其致病力。
高品質複合肥能提供冬瓜必須的N、P、K，使有機肥的長效和化肥的速效相結合。另外，不要在大雨前施，也不要在雨後立即施；偏施過濃的速效氮肥，容易引起枯萎病和疫病。對過酸的土壤，施用石灰中和土壤酸性有助於提高抗病力。
三、高畦排水，選用抗病品種
冬瓜植株生長旺盛，產量高，消耗養分和水分均多。但冬瓜又不耐浸，多雨季節瓜田水分過飽和漚根，會引發多種病害。築高畦，保證排水暢通是高品質高產量的基本要素；結瓜期間保證均勻澆(淋)水，對於瓜的正常生長也很重要。時干時濕，瓜形不正，品質差甚至停止發育。
