(1)貯藏窖(庫)和包裝材料消毒做好甜瓜貯藏保鮮工作。除了挑選完整無損的果實外，貯藏窖(庫)和包裝材料的消毒也是十分重要的。把包裝材料放在貯藏庫中，用薰硫方法，每100立方米容積用硫黃約3千克、把硫黃與鋸末摻在一起，點着使其發煙，關閉門窗、薰兩天，然後打開庫門窗通氣；也可以用2％的指爾馬林溶液噴灑消毒。
(2)庫內甜瓜的堆碼和吊掛甜瓜經過挑選、分級後裝入果箱中，搬入貯藏庫。箱在庫內按一定方式堆放、放穩。在果垛底放托盤等物，注意堆與堆之間、果垛與牆壁及庫頂之間均應留有一定的距離，便於通風換氣。一般每立方米可放果實100—150千克。有些產瓜區，甜瓜在貯藏庫不是裝箱貯存，而是成堆散放，即在貯藏庫內用竹、木、鋼，筋及蘆葦、秸。稈等搭成架子，再把甜瓜按層整齊地擺在架子上。也有的窯(庫)貯藏甜瓜時，不用箱裝，也不用架放，而是．建窯時在窯的項部放上橫木，用3根繩子打成3個結，每個結處吊放一個甜瓜，每條繩子上吊放3個瓜。甜瓜的放法是由上而下。窯裏放完瓜後，除了人行進外，全窯都是吊放的甜瓜，看起來也很美觀。這是新疆瓜農沿用的古典方法，也是新疆哈密瓜窯的一大景觀。無論是散放的、箱裝的或繩子吊放的甜瓜，在甜瓜放置時，把耐貯藏；晚出庫的品種放在庫的裏邊，耐貯藏性差的放在靠庫門的一端，這樣便於管理，出庫方便。
(3)庫內温度、濕度和通風管理甜瓜貯藏庫温度、濕度和通風管理是一項很重要的工作，不僅對自然濕度庫(包括棚窖、通風庫、地下庫)是這樣，對機械冷藏庫也是如此。自然温度庫的通風降温按季節可分為三個階段。①秋季北方地區白天和夜間氣温有一定差別；初入窖的甜瓜，果温和窯温均高，呼吸作用旺盛，加上甜瓜帶入的田間熱，使窖温升高。這時利用通風設備，把外界的低温引入窯內，降低窖温和果温。②冬季氣候寒冷，甜瓜經過秋季一段時間的貯藏，已經或接近適於貯藏温度。這時的管理主要是保温防凍。特別要注意防止冷空氣突然進入窖內，傷害甜瓜。窖內的通風換氣應在白天中午氣温較高時進行。換氣時間不宜過長，通風次數也要比秋季少。②春季立春以後，氣温和土温回升較快，這時的管理主要是防止窖温升高。白天氣温高時把窯的門窗和通氣孔全部堵塞，夜間外界氣温比容温低時，打開門宙和通氣孔，進行氣體交換，儘可能使窖温保持較長時間的低温，以延長甜瓜貯藏時間。—通風換氣除了降低窖温外，還可以把庫內不適合甜瓜貯藏的氣體，如乙烯等排出庫外，以利於甜瓜貯藏。機械冷藏庫和氣調庫密封性能好。前者用風機更換庫內空氣，後者除了調節庫內氧和二氧化碳濃度比例外，也要採取措施吸除庫內對甜瓜貯藏不利的氣體成分，淨化空氣。濕度是影內貯藏甜瓜品質的重要因素之一。濕度低，甜瓜自然損耗多；嚴重時，甜瓜失水萎縮，影響商品價值。由於庫內通風換氣，使貯藏庫內濕度下降，所以要給庫內適當加濕，一般空氣相對濕度似80％一90％為宜。
(4)甜瓜貯藏的輔助措施化學防腐劑在甜瓜貯藏中有一定作用。蒲彬等採用水果防腐劑抑黴唑(簡稱YMC)處理炮台紅甜瓜，不僅艙降低甜瓜的腐爛率，而且還可以減輕瓜的腐爛程度。在窖温1—7Ｃ，空氣相對濕度為86％—94％的範圍內；用0.05％和0．075％的濃度處理炮台紅，貯藏89天，其腐爛率均為2．5％，貯藏100天，腐爛率分別為15%和17．5％，比未用藥劑處理的好瓜串提高了130％以上，同時推遲了甜瓜的開始腐爛期。貯藏89天后，以O．05％和0．075％的濃皮處理；甜瓜的腐爛指數分別為23.75％和15％；仍具有較高的商品價值。從甜瓜的貯藏來看，哈密瓜的適宜貯藏期為3個月。若用抑黴唑的適合濃度處理炮台紅，貯藏期可延長到100天，好瓜率達８５％以上。
